Структурное подразделение (ЦПМПК) стало частью Государственного бюджетного учреждения Пермского края "Центр психолого-педагогической, медицинской и социальной помощи" в 2016 году после изменения названия существующего Государственного казенного учреждения Пермского края «Центральная психолого-медико-педагогическая комиссия» в соответствии с распоряжением Правительства Пермского края от 25 августа 2016 г. № 243-рп на Государственное казенное учреждение Пермского края «Центр психолого-педагогической, медицинской и социальной помощи», которое было создано путем изменения типа существующего Государственного казенного учреждения Пермского края "Центр психолого-педагогической, медицинской и социальной помощи" в соответствии с распоряжением Правительства Пермского края от 30 августа 2018 г. № 218-рп.
В свою очередь Государственное казенное учреждение Пермского края «Центральная психолого-медико-педагогическая комиссия» являлось правопреемником областной психолого-медико-педагогической комиссии, созданной в Пермской области в 1994 году.
В 2010г. учреждение переименовывают в Государственное краевое учреждение «Психолого-медико-педагогическая консультация» - Приказ АУГУ СЭД -51-01-01-283 от 22.07.2010г.
Затем учреждение еще раз переименовывают в Государственное казенное учреждение Пермского края «Центральная психолого-медико-педагогическая комиссия» - распоряжение Правительства Пермского края № 7-рп от 21.01.2011г.